Российские ученые освоили поиск мутантных белков раковых клеток

Совместное исследование аспиранта МФТИ Анны Лобас с коллегами из Института биомедицинской химии РАН, МФТИ и Института энергетических проблем химической физики РАН позволило разработать экспериментальный алгоритм поиска мутированных участков в белках, содержащихся в геноме человека. Изучение мутировавших белков позволит в будущем обнаруживать "слабые места" в клетках опухоли и разработать более эффективные препараты. Результаты исследования публикует журнал Proteomics.

Исследование российских ученых, задавшихся целью научиться обнаруживать мутантные белки, основано на сравнении масс-спектрометрических результатов исследований разных групп, с помощью которого можно выделить онкологические мутации.

Для своего анализа ученые создали расширенную базу данных исследований участков генов, которые кодируют последовательность аминокислот в белке HEK-293. Благодаря новой базе данных ученые запустили поиск "неправильных" белков, отличающихся от "эталонных" и позволяющих отличить опухолевую клетку от нормальной.

Новый подход к анализу на основе расширенной базы данных позволил ученым найти в клетках HEK-293 113 уникальных вариантов последовательностей пептидов, некоторые из которых достоверно имели отношение к различным типам рака.

Как полагает один из руководителей проекта заведующий лабораторией физико-химических методов исследования структуры веществ ИНЭПХФ РАН Михаил Горшков, разработанный учеными подход может использоваться для поиска мутаций, связанных с раком. Изучение этих мутаций поможет в анализе белкового состава опухолей и разработке "препаратов-убийц", целью которых станет разрушение мутантных белков опухолевых клеток.